Dojenje može pomoći djetetu da ne dobije celijakiju, netoleranciju na gluten. Ljudi koji u mladosti dobiju taj sindrom trajno su alergični na gluten, protein koji se nalazi u žitaricama. Razvoj celijakije ima svoju genetsku podlogu, ali ništa manje nisu važni ni uvjeti u kojima žive dojenčad.  

Djeca koja su dojena redovno prije davanja druge hrane imaju 52 posto manje šanse za razvoj celijakije. Nije poznat mehanizam kako dojenje utječe na razvoj ove bolesti, niti je poznato da li je taj učinak trajan.

Moguće je da za vrijeme dojenja dijete prima malo glutena pa ne stigne razviti imunološki odgovor u najranijoj mladosti. Moguće je i to da majčino mlijeko smanjuje broj gastrointestinalnih upala, štiteći zaštitni sloj u crijevima.