Antibiotici su vrlo korisni, ali su loši po dobre bakterije koje žive u crijevima. Većina bakterija se regenerira u crijevima nakon mjesec i po, ali se ne vraćaju sve u normalu. Šest mjeseci poslije uzimanja antibiotika, ljekari su kod nekih pacijenata uočili nedostatak krucijalnih bakterija.
Dobra vijest je što se crijevna flora najvećim dijelom obnavlja sama od sebe, ali zabrinjava to što nakon nekog vremena uzimanja antibiotika dolazi do gubitka važnih bakterija.