Metabolički poremećaji imaju veliku važnost u diferenciranju epileptičkih napada, jer većina ima dosta sličnosti s epilepsijom. Među ovim poremećajima najvažniji su oni s promjenama nivoa šećera u krvi.
Nivo kalcija
Mora se misliti posebno na hipoglikemiju koja često nastaje kod liječenja dijabetičara, kada nastaju prolazni poremećaji cerebralne cirkulacije koje prate drhtavica, slabost, omaglica, konfuzija, razdražljivost i grčevi mišića, pa postoji opasnost da se zamijene s epileptičkim napadima.
S druge strane, hipoglikemija pogoduje manifestacijama i kod epilepsije kontrolirane antiepilepticima. I povišen šećer u krvi rjeđe se može zamijeniti s parcijalnom epilepsijom zbog abnormalnih pokreta.
Snižen nivo kalcija u krvi može stvoriti probleme u diferenciranju. Povišeni nivo kalcija može izazvati toničko-kloničke grčeve, ali je važno da u kliničkoj slici postoje i drugi simptomi tipični za hiperkalciemiju, pa je diferencijacija relativno laka.